Pour mieux contrôler la maladie de Crohn, il existe plusieurs mesures à préconiser. 

• Une adaptation du régime alimentaire : il est nécessaire pour les patients de suivre un régime riche et varié leur permettant un apport énergétique et nutritionnel adapté à leur état
• Une médication adaptée : dans le but de réduire l’inflammation du tissu et l’apparition des symptômes (diarrhée, fièvre et douleurs abdominales).
  • les anti-inflammatoires
  • les immunomodulateurs
  • les antibiotiques
  • la supplémentation en fer
• La chirurgie : elle est envisagée quand la médication n’est pas suffisante et dans le cas de certaines complications (comme les fistules, les abcès et les occlusions intestinales). Généralement, l'intervention chirurgicale consiste en une résection de la partie inflammée de l’intestin. Même si les symptômes disparaîssent pendant plusieurs années, il est possible de voir la maladie réapparaître.